短程分子蒸馏器身上有很多吸引我们的地方，它的结构就是其中之一，这也说明体现出它构造的单独性，它之所以能有好的使用效果，与这方面也有莫大的关系。
短程分子蒸馏器中采用的是传动与机械密封设计，这可以充分让设备长期平稳运行；同时根据它的工况和物料特性确定传动装置的减速比、机械密封的润滑方式以及机械密封的冷却方式。这也是设备稳定运行的基仔细观察可以发现 短程分子蒸馏设备的蒸发筒体整体加工成型的，并没有中间法兰连接，成为了它的主要部件。这样的制造方式不但避免了法兰连接带来的泄漏和物料积留，而且避免了法兰两侧出现低温区，导致蒸发面得不到利用。
筒体内表面作为它的加热蒸发面。对表面光洁度是有严格的要求的，通过精磨使其内表面光洁度有较高的水平，让内表面不易粘料和结垢，减少物料滞留，增加传热传质效率。
不但是这些，短程分子蒸馏器中还有液体分布器和防溅装置设计，这不但能均匀的把物料分布到加热面上，还能规避少量物料在分布器上长时间滞留，对于高粘度的物料也是如此，是生产好的产品的有力保障。