分子蒸馏设备适用于分子蒸馏，从加热表面到冷凝器表面的分子流量不是一个简单的步骤。一般来说，液相扩散率是控制分子蒸馏速度的主要因素，因此应降低液层厚度，加强液层流动。

分子蒸馏设备的蒸发率随温度的增加而增加，但分离系数有时随温度的增加而降低。因此，应根据加工材料的热稳定性选择经济合理的蒸馏温度。蒸汽分子在蒸发到冷凝表面时可能相互碰撞，并可能与两侧的空气分子相撞。

由于蒸发分子比空气分子重得多，而且大多数蒸发分子都有相同的运动方向，所以它们自身的碰撞对飞行方向和蒸发率基本没有影响。残留分子在两侧混乱，因此残留分子的数量是影响蒸发方向和蒸发速度的主要因素。

只要冷热两侧有充足的温差，冷凝面合理光滑，就可以认为冷凝步骤可以及时完成，因此选择合理的形式很重要。沸膜与冷凝面之间的压差是蒸汽流动的驱动力，使用时的小压力会导致蒸汽流动。

在蒸馏过程中，良好的将材料从分子蒸馏设备顶部添加，良好的通过转子上的材料液体分布器均匀地分布在加热表面，然后刮膜器将材料液体刮成很薄的液体膜。

逃离下表面的轻分子通过短路线凝结成液体，基本没有与内置冷凝器碰撞，沿冷凝管流动，通过分子蒸馏设备底部的排放管排出，在加热区下的圆形通道中收集残留液体，然后通过侧排放管流出。