短程分子蒸馏仪是利用液相中轻重组份分子逸出液相主体时分子自由程的差来实现分离。要实现分子蒸馏的基本条件是：轻组份分子逸出的分子自由程等于加热面与冷凝面的距离，能正确到达内置冷凝器实现捕集，而重组份分子逸出的分子自由程要小于加热面与冷凝面的距离，使其不到达内置冷凝器，也就是内置冷凝器只捕集轻组份的分子，实现轻重组份的分离。

　　短程分子蒸馏仪就是根据分子蒸馏的原理而设计的，是模拟分子蒸馏的模型，由于其加热面和冷却面的距离近，阻力小，故称短程分子蒸馏器。由于内置冷凝器的作用，能把汽化的汽相液化，收缩体积，因此能维持设备内的高真空。 短程分子蒸馏设备的操作真空可达0.1Pa，是其它蒸发、蒸馏设备无法达到的。因此，短程分子蒸馏仪系统的温度可以达到200℃，适用于在常压下高沸点，用普通分离方法不好分离的物料，作为一种新的液分离设备已应用于多行业。根据物料特性的不同，也有许多刮板形式的选择，原理与刮板蒸发器相似。

　　短程分子蒸馏仪的处理能力：

　　由于短程分子蒸馏仪一般是用来处理沸点高的物料，通常粘度都较高，又通常是用导热油加热，因此分离能力也较小，根据物料的不同，分离能力为30-70kg/ m2.hr。